Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms