Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms