Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms