Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smpd3Q9JJY3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms