Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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