Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfhx4Q9JJN2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Zfhx4Q9JJN2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zfhx4Q9JJN2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfhx4Q9JJN2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms