Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc86Q9JJ89 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms