Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms