Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod3Q9JHJ0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod3Q9JHJ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms