Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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