Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms