Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pgpep1Q9ESW8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms