Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Usp29Q9ES63 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Usp29Q9ES63 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Usp29Q9ES63 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Usp29Q9ES63 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Usp29Q9ES63 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Usp29Q9ES63 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Usp29Q9ES63 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Usp29Q9ES63 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Usp29Q9ES63 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms