Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chrnb2Q9ERK7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrnb2Q9ERK7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms