Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms