Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms