Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms