Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox9Q9EQM5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox9Q9EQM5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms