Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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