Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf8Q9EQH4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf8Q9EQH4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms