Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Vmn1r46Q9EQ45 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r46Q9EQ45 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r46Q9EQ45 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r46Q9EQ45 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r46Q9EQ45 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r46Q9EQ45 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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