Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r56Q9EPS9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r56Q9EPS9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms