Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tlr1Q9EPQ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tlr1Q9EPQ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tlr1Q9EPQ1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tlr1Q9EPQ1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms