Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdf2Q9DCT5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sdf2Q9DCT5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sdf2Q9DCT5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms