Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgn3Q9DCB1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms