Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms