Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms