Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms