Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnn3Q9DAW9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms