Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrmuQ9DAT5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms