Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp12Q9D9M2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp12Q9D9M2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp12Q9D9M2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp12Q9D9M2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp12Q9D9M2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp12Q9D9M2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms