Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hm13Q9D8V0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms