Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SlirpQ9D8T7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms