Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms