Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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