Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl4Q9D8E6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms