Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms