Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tmem54Q9D7S1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tmem54Q9D7S1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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