Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms