Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms