Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Klhl40Q9D783 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl40Q9D783 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms