Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms