Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbe1Q9D6Y9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms