Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms