Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms