Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms