Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pabpc6Q9D4E6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pabpc6Q9D4E6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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