Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms