Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmntd1Q9D4C1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmntd1Q9D4C1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmntd1Q9D4C1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms