Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933428M09RikQ9D3X3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms